左手の違和感はおそらく手が股のほうに内転しすぎてるからではないでしょうか。
この角度だと手は真正面を向くか、やや外転したほうが自然かもです。

参考サイトはご紹介できるものが心当たりないので…とりあえずｸﾞｰｸﾞﾙ先生で「片膝立ち」あたりで画像検索してみると色々参考になりそうなものは出てくるかと思います。

気になってる左手ですが、指の付け根の部分と手首がほとんど同じ場所にあるのはちょっとおかしいですし、ふとももに乗せている意図なのでしょうが手の位置が内にきすぎて股上のスカートにのせているように見えました。
本来でしたらこの体制で太ももの上に手を置けば腕は曲がるはずですが、腕が短いために腕が真っ直ぐになってしまってるのも違和感の原因なんではないでしょうか。

たんに立っている、座っている動作で戦闘させるのは攻撃、防御時にかなりの枚数が必要そうですが、大丈夫でしょうか。

http://www.rupan.net/uploader/download/1402436128.jpg

腕の長さはやはり少し気になりますね。
表情は舞台役者のように、強く差をつけなければ差が判りにくいです。
スカートは体の起伏を意識して。
座った時の膝の裏側のラインはふくらはぎも結構主張します。画面から見てどちらが前になってるかきをつけて。
足全体の角度が非常につらそうです。プルプルしそう。

追記：屈みモーションの刀の持ち方、このような持ち方をするなら両手で握らなければ、相当な負担が右腕にかかると思います。ニュートラルと同じか、他の剣持ちキャラのようにいっそ別にした方がよいかなと。