黄色と肌色は色合いが近いので仕方ない面もありますが、画像を見るに肌の影の色が薄いのも要因のように思えます。
これくらいのメリハリをつけておくと識別もしやすいのではないでしょうか?
http://i.imgur.com/EMrwMYY.gif色修正は一旦置いておくとのことですが気になったので一応。
>追記
気になるか、と聞かれれば気になると思います。
原作を知っている方であればなおのことかもしれませんね。
ドット絵で肌が黄色か白色かというのは影の色合いで印象が変わりやすいです。
影をもう少しだけ明るく、かつRGBの緑を抑え目に調整すれば白人っぽくなるかなと思います。
>追記2
納得できた地点がとりあえずのゴールでいいと思いますよ。
色合いを調整するだけなら後からでも簡単にできますし。
と、それだけというのも無責任だと思うので、
自分ならここまでするかなと調整したものを一応置いておきますね。
http://i.imgur.com/AkHCnxy.gif