等身高くなりましたねー。　作画が定まらないのはキャラ設定があやふやだからってのも一因かと。

どのくらいの年齢を想定して作ってるんでしょうか？あと剣の素人なのか玄人なのかでも
構えに対する考えが違ってきそうな気がします

左端の違和感はふくらはぎの膨らみが無いことが一番か。

右二枚にもそれはいえるのですが、
右のはむしろ足が短いために違和感というよりも
スタイルが良く見えないというのが問題なのかと。
スカート（緑色の部分）の中ほどが膨らんでいるので
そこがヒップラインになるかと思われますが
よく見るとちこっと低いですよね。

男女で多少の違いはありますが、
スタイルが良く見える体のバランスは一般に
直立時に肘が腰のくびれの高さ、手首が股下と揃う高さ、
脚の長さと（頭を含めた）脚以外の部分の長さが
1：1というものです。
また、腿：脛（足先含む）も1：1かやや脛の方が
長いくらいだと格好がいいようです。

自分がやってたやり方ですが、ポーズつけてない棒立ちのドット絵を作ってから以降それを基準に作成していくといいかも・・・棒立ちならバランスも狂いにくいと聞きますし。

ひとつのものをベースに修正を重ねていくとわけがわからなくなっていきやすいので、行き詰ったらいっそ棒人間から書き直してみるのもいいかもしれません。
修正する場合も、服を着せてない素体状態を別レイヤーに適当に描いて目指すバランスをある程度決めてからやれば終着点が決めやすいと思います。
http://mugendoteita.main.jp/DotoEita/02_Suploda/hokan/file351.png

等身が高くなったのはオリキャラサイズチェックシートの影響でしょうか？ちょっとこの子のビジュアルだと違和感がありますね。実は改変させて頂いてる時にキャラのドットサイズがD4なのかよく分からない大きさだったので心配していたのですが・・。
等身自体は前の絵で問題ないと思うので、サイズを大きくしたければ他のD4キャラを横に置いて、基準となる顔ドットをアルカナサイズ等に作り直した方がいいかもしれませんね。それかキャラのデザインそのものを変えて今の等身でもおかしくないようにするかだと思います。私も女キャラはそこらへんの折り合いがつかずにやめてしまったので、大変かと思いますががんばってください。zouazarasiさんがすばらしいドットを打って下さってるのでそれを参考にすれば比較的簡単にできると思いますので。

まあ、数描くしかないっすよねこういうのは。

細部に拘った結果全体のバランスが大きく崩れたように感じます。で、クセとして感じるのは、胴から腰、足への流れが上手くいってない事です。
鎖骨から胸、胸から胴が一般の絵よりも相当長いように見受けられます。
腰と脚の関節のつながりがどうなっているのかをしっかり勉強する必要があると感じます。

某プロジェクトに参加しようとして挫折したシロモノですが、よろしければこれを参考にしてください。

http://mugendoteita.main.jp/DotoEita/02_Suploda/hokan_olduploda/02_Quploda/186.txt

また、google先生に「人体　描き方」とかで問い合わせればこういったもので絵つきで詳しく私よりも上手く紹介されているサイトは沢山みつかると思います。

こういう地力というのはごまかしにくく、また身につけるのも時間がかかりますので、超がんばれ！

D4にするときに縦の延長に気をかけすぎてる感じでしょうか
サイズが大きくなるということは頭や首、肩といったところもきっちり縮尺しないと縦長の変な人間になっちゃいますよ？
(画面に対して)正面立ちをイメージするかすると判りますが
・頭が一回り小さく首が以前の縮尺のままなので頭に対して肩の距離がやたら近い
・胴の幅の拡大をしていないためやたら長く見える

とぱっと見感じますね
個人的意見としてはリアル人型のものを参考にしたりしつつ骨格を理解したほうがいいと思います。